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CSV 파일을 처리하기 위해 하나의 스크립트에 여러 sed 명령을 추가합니다.

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CSV 파일을 처리하기 위해 하나의 스크립트에 여러 sed 명령을 추가합니다.

다음과 같은 CSV 파일이 있습니다.

HEADER
"first, column"|"second "some random quotes" column"|"third ol' column"
FOOTER

그리고 다음과 같은 결과를 찾으세요.

HEADER
first, column|second "some random quotes" column|third ol' column

즉, FOOTERstart, end 및 around 에서 따옴표를 제거합니다 |.

지금까지 이 코드는 작동합니다:

sed '/FOOTER/d' csv > csv1 | #remove FOOTER
sed 's/^\"//' csv1 > csv2 | #remove quote at the beginning
sed 's/\"$//' csv2 > csv3 | #remove quote at the end
sed 's/\"|\"/|/g' csv3 > csv4 #remove quotes around pipe

보시다시피 문제는 4개의 추가 파일을 생성한다는 것입니다.

추가 파일을 생성하지 않고 단일 스크립트에서 동일한 작업을 수행하는 것을 목표로 하는 또 다른 솔루션이 있습니다. 효과는 별로 좋지 않습니다.

#!/bin/ksh

sed '/begin/, /end/ { 
        /FOOTER/d
        s/^\"//
        s/\"$//
        s/\"|\"/|/g 
}' csv > csv4

답변1

첫째, Michael이 보여준 것처럼 이 모든 것을 하나의 명령으로 결합할 수 있습니다.

sed '/^FOOTER/d; s/^\"//; s/\"$//; s/\"|\"/|/g' csv > csv1

일부 sed구현에서는 이에 대처할 수 없으며 다음을 수행해야 할 수도 있습니다.

  sed -e '/^FOOTER/d' -e 's/^\"//' -e 's/\"$//' -e 's/\"|\"/|/g' csv > csv1

즉, 필드가 정의된 것처럼 보이며 필드 내에 필드를 남겨두고 전체 필드를 |삭제하려는 경우입니다 . "이 경우 다음을 수행할 수 있습니다.

$ sed '/FOOTER/d; s/\(^\||\)"/\1/g; s/"\($\||\)/\1/g' csv 
HEADER
first, column|second "some random quotes" column|third ol' column

또는 GNU를 사용하십시오 sed.

sed -r '/FOOTER/d; s/(^|\|)"/\1/g; s/"($|\|)/\1/g' csv

Perl을 사용할 수도 있습니다.

$ perl -F"|" -lane 'next if /FOOTER/; s/^"|"$// for @F; print @F' csv 
HEADER
first, column|second some random quotes column|third ol' column

답변2

이것은 또한 작동합니다:

sed's/^"//;s/"|"/|/g;s/""$/"/'

예:

$ echo '"this"|" and "ths""|" and "|" this 2"|" also "this", "thi", "and th""' | 
sed 's/^"//; s/"|"/|/g; s/""$/"/'
this| and "ths"| and | this 2| also "this", "thi", "and th"

좋은 버전

sed '
s/^"//
s/"|"/|/g
s/""$/"/
$d
'

답변3

sed나를 위해 일한 명령은 다음과 같습니다.

sed 's/ALA/A/g;s/CYS/C/g;s/ASP/D/g;s/GLU/E/g;s/PHE/F/g;s/GLY/G/g;s/HIS/H/g;s/HID/H/g;s/HIE/H/g;s/ILE/I/g;s/LYS/K/g;s/LEU/L/g;s/MET/M/g;s/ASN/N/g;s/PRO/P/g;s/GLN/Q/g;s/ARG/R/g;s/SER/S/g;s/THR/T/g;s/VAL/V/g;s/TRP/W/g;s/TYR/Y/g;s/MSE/X/g;s/ //g'  < old.txt > new.fasta

sed 명령은 파이프될 수 없습니다. 단일 명령으로 제공되어야 합니다.

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