GUI 인터페이스부터 시작하여 마침내 모든 것을 텍스트로 전송하는 것의 힘을 이해했지만 아직 모든 것을 사용하는 방법을 몰랐습니다.
특정 프로젝트의 작업 흐름이 다음과 같다는 것을 알고 있습니다.
# compile repo 1
cd ~/workspace/repo1
make -B
# deploys compiled code into repo2
make deploy
# commit repo 1
cd ~/workspace/repo1
git add .
git commit -m "changes"
git push origin master
# commit repo 2
cd ~/workspace/repo2
git add .
git commit -m "changes"
git push origin master
내 질문은 이것을 달성하는 방법이 아니라 올바른 도구는 무엇입니까? 읽어보니 Bash 스크립팅이 필요한 것 같은데 전문가에게 문의하고 싶습니다.
답변1
모든 내용을 한 곳에 입력하면 이미 좋은 시작이 된 것입니다.
모든 것을 텍스트 파일에 복사하고(예를 들어 workflow.sh
이름은 중요하지 않음)파일의 첫 번째 줄에:
#!/bin/sh
이제 쉘 스크립트가 생겼습니다. 실행 가능하게 만드세요:
chmod +x workflow.sh
이제 다음 명령처럼 실행할 수 있습니다.
./workflow.sh
워크플로를 호출하면 각 명령이 순서대로 실행됩니다.
당신은 이제 초보 시스템 프로그래머입니다. 거기에서만 올라갈 수 있습니다.
고쳐 쓰다
지정하다다양성변경할 때마다 스크립트를 편집할 필요가 없습니다.
git commit -m "changes"
읽다:
git commit -m "$1"
그러면 합격할 수 있어요다양성명령줄 인수로:
./workflow "Describe changes made"
또 다른 유용한 도구는 별칭 및 입니다 PATH
. 특수 디렉터리(예: ~/bin
)를 만들고 모든 스크립트를 여기에 넣을 수 있으며, 이 디렉터리를 PATH
변수에 추가하면 경로를 시작할 때마다 전체 스크립트를 입력할 필요가 없습니다. 별칭을 사용하는 경우 각 스크립트에 대한 별칭을 만들어야 하지만 때로는 별칭에 다른 실행 매개변수를 지정할 수 있기 때문에 별칭이 더 편리합니다.
답변2
Python 유틸리티를 사용하여 코드를 구성할 수 있습니다.https://wiki.python.org/moin/FlowBasedProgramming
위에서 언급되지 않았지만 여전히 유망한 또 다른 패키지는 Snakemake입니다.