10개의 .bam 파일(생물정보학 형식)이 있고 이를 10개의 .bed 파일로 변환하고 싶지만 이 변환을 위해서는 특수 명령을 사용해야 합니다.
bedtools bamTobed -i (input file) > output file.bed
답변1
귀하의 질문은 명확하지 않지만 이 쉘 명령이 도움이 될 수 있습니다.
for x in *.bam; do
bedtools bamTobed -i "$x" >"${x%.bam}.bed"
done
답변2
다음을 수행할 수 있습니다.
parallel --jobs <int> "bamToBed -i {} > {.}.bed" ::: *.bam