$ script.sh -i /storage/testFile
-i
저장소 경로입니다 /storage/testFile/
.
testFile
모든 것이 잘 진행되고 있지만 이 코드를 더 명확하게 만들고 출력 및 기타 검사를 위한 디렉터리를 추가하고 싶습니다 .
내 코드 조각은 다음과 같습니다
for f in $inDir/*.vcf; do
if [ -f $f ]; #check if file is true or exists
then
if [ ${f: -4} == ".vcf" ] # check if the file ends with .vcf
then
convert2annovar.pl -format vcf4 "$f" > ./"$f".avinput #run my code
fi
fi
done
질문:
echo $f
반품 /storage/testFiles/test.vcf
. test.vcf
루프가 반복될 때만 얻는 방법은 무엇입니까 for
?
답변1
다음을 사용해야 합니다 basename
.
Synopsis
basename NAME [SUFFIX]
basename OPTION
Description
Print NAME with any leading directory components removed. If
specified, also remove a trailing SUFFIX.
그래서:
$ basename /storage/testFiles/test.vcf
test.vcf
또는 반대가 필요한 경우 다음을 사용할 수 있습니다 dirname
.
$ dirname /storage/testFiles/test.vcf
/storage/testFiles