일부 데이터에 대해 FASTQC를 실행하려고 합니다. 저는 루트 액세스 권한이 없는 서버에서 작업하고 있습니다. 서버에 대한 루트 액세스 권한이 없고 파일의 압축을 풀 수 없기 때문에 내 집 공간에 fastqc를 설치할 수 있는 방법을 아는 사람이 있습니까?
답변1
사용conda설치하다 fastqc. 나는 conda별도의 도구에 대해 별도의 환경을 사용하는 것을 선호하지만 YMMV입니다. bioconda채널에 포함되지 않은 경우 영구적으로 추가하거나 다음 명령을 사용하여 추가하세요 -c bioconda.
예:
# Install the most recent version of fastqc in environment
# called also "fastqc" (or use a different name):
conda create -n fastqc fastqc
# Install a specific version of fastqc into its own environment:
conda create -n fastqc-0.11.9 fastqc=0.11.9