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tgz 아카이브를 추출할 때 "gzip: stdin: 잘못된 압축 데이터 - 형식 위반" 오류 발생

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tgz 아카이브를 추출할 때 "gzip: stdin: 잘못된 압축 데이터 - 형식 위반" 오류 발생

tar 파일을 열어야 합니다. Unix 셸에서 다음 명령줄을 사용했습니다.

tar xfvz raw-GWA-data.tgz

다음과 같은 오류 메시지를 발견했습니다.

gzip: stdin: invalid compressed data--format violated
tar: Child returned status 1
tar: Error is not recoverable: exiting now

그런 다음 다음 명령줄을 시도했습니다.

tar -xvzf raw-GWA-data.tgz   
tar --extract --file raw-GWA-data.tgz  
tar xzf raw-GWA-data.tgz   
tar -xf raw-GWA-data.tgz

동일한 오류가 발생하여 tar 파일을 열 수 없습니다.

뭐가 문제 야? tar 파일을 여는 다른 방법이 있나요?

답변1

hexdump(여기서 채택된) 문서를 보면 (fromhexdump -Chttps://www.nature.com/articles/nprot.2010.116#Sec27현재 삭제된 답변에서 다른 사람들이 언급했듯이)

00000000 1f 8b 08 00 cd b6 e3 4c 00 03 d4 bd 5f 8c 23 5b |.....L....._.#[|
00000010 7a 1f 46 71 82 80 62 0f 66 0c 3f 04 86 0c 18 0c |z.Fq..bf?.....|
00000020 47 50 68 b2 45 CE F6 AC E4 36 39 26 05 09 01 12 |GPh.E....69&....|
00000030 19 88 83 20 79 c8 93 b1 92 15 3b 52 bc 57 90 64 |...y...;RWd|
00000040 c4 d1 0d0a3b 0c 3b 0f 34 39 e8 16 f4 12 43 0b |....;.;.49....C.|
00000050 e8 32 45 61 55 7b 8a 5b 67 d2 9d ec e5 d6 e1 광고 |.2EaU{.[g......|
00000060 33 98 09 ac 0e 79 43 02 f1 9b ae 73 a7 4d 1a bb |3....yC....sM.|
00000070 54 15 55 67 d2 8c ef 70 eb 70 ce c9 77 4e 91 dd |T.Ug...pp.wN..|
00000080 ec 9e 9e bf 77 f6 1a aa dd 3b cd 66 93 f5 ab df |....w....;.f....|
00000090 f7 ef 7c df f9 fb 8f는 f6 9b ff f8 6b bf 79 e7 |..|.........ky|
000000a0 b7 76 fe fe 2f fd c7 ff 55 fe 97 fe 93 5f cc ff |.v../...U...._..|
000000b0 f2 7f fe 5f e6 ff eb ff e2 3f cd ff 37 1f fc 93 |..._.....?..7...|
000000c0 af ff 83 5f fb ad df ce 7f fd 83 9f fd da ef fc |...---.|
000000d0 ec af fe c3 9f fd ed af ff e6 6f e7 7f e5 d7 fe |..........o....|
000000e0 41 ec 2d af db 70 fd fc 57 bf 0d0a3f ef 7c 65 |A.-..p..W...?.|e|
000000f0 e7 e7 d5 cf db 3b 3b 5f fd 0d0afc fc f9 af dc |.....;;_.....|

모든 0x0a 바이트(ASCII에서 문자로 해석되는 경우 개행 문자, 일명 LF / 개행 // \n문자 임 ^J) 앞에는 0x0d 바이트(캐리지 리턴 문자, 일명 CR에 해당함)가 앞에 있습니다. ^M/ / \r).

모드를 로 설정하지 않고 FTP를 통해 Unix 컴퓨터에서 Microsoft 컴퓨터로 파일을 전송하는 경우바이너리, 그러면 줄 끝이 즉시 LF에서 CRLF로 변환됩니다.

여기에서 모든 CRLF를 다시 LF로 변환하여 이러한 손상을 되돌릴 수 있습니다 perl -pe 's/\r\n\z/\n/'. 예를 들면 다음과 같습니다.

$ bsdtar tf Downloads/41596_2010_BFnprot2010116_MOESM396_ESM.zip
raw-GWA-data.tgz
$ bsdtar xOf Downloads/41596_2010_BFnprot2010116_MOESM396_ESM.zip | perl -pe 's/\r\n\z/\n/' | bsdtar tvvf -
-rw-r--r--  0 ca3    team152 103669932 Mar  9  2010 hapmap3r2_CEU.CHB.JPT.YRI.founders.no-at-cg-snps.bed
-rw-r--r--  0 ca3    team152  29166116 Mar  9  2010 hapmap3r2_CEU.CHB.JPT.YRI.founders.no-at-cg-snps.bim
-rw-r--r--  0 ca3    team152      8813 Mar  9  2010 hapmap3r2_CEU.CHB.JPT.YRI.founders.no-at-cg-snps.fam
-rw-r--r--  0 ca3    team152  10664954 Mar  8  2010 hapmap3r2_CEU.CHB.JPT.YRI.no-at-cg-snps.txt
-rw-r--r--  0 ca3    team152       417 Jan  7  2010 high-LD-regions.txt
-rw-r--r--  0 ca3    team152       718 Feb 16  2010 imiss-vs-het.Rscript
-rw-r--r--  0 ca3    team152         9 Mar  9  2010 pca-populations.txt
-rw-r--r--  0 ca3    team152       283 Mar  3  2010 plot-IBD.Rscript
-rw-r--r--  0 ca3    team152       776 Jun  4  2010 plot-pca-results.Rscript
-rwxr-xr-x  0 ca3    team152  11747611 Jan  6  2010 raw-GWA-data.map
-rw-r--r--  0 ca3    team152 2540057786 Jan 14  2010 raw-GWA-data.ped
-rw-r--r--  0 ca3    team152       1217 Mar  8  2010 run-IBD-QC.pl
-rw-r--r--  0 ca3    team152        327 Mar 11  2010 run-diffmiss-qc.pl
-rw-r--r--  0 ca3    team152     511429 Jan  7  2010 raw-GWA-data.prune.in
Archive Format: GNU tar format,  Compression: gzip

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