다음과 같은 파일이 있습니다 A.txt
(필드 구분 기호 = ;
).
kit;;;;;;;
Software Version = cti;;;;;;;
Date And Time of Export = 06/02/20 14:14:11;;;;;;;
Experiment Name = taqpath-AB17500-plate7587;;;;;;;
Instrument Software Version = ;;;;;;;
Instrument Type = sds7500fast;;;;;;;
Instrument Serial Number = ;;;;;;;
Run Start Date = Tue Jun 02 12:00:40 CEST 2020;;;;;;;
Run End Date = Tue Jun 02 13:14:42 CEST 2020;;;;;;;
Run Operator = FE;;;;;;;
Batch Status = VALID;;;;;;;
;;;;;;;
그리고 B.csv
(필드 구분 기호 = \t
):
Well Cycle Target Name Rn ΔRn Sample Name
A1 1 N gene 512629.375 1004.0445 B1000-1
A1 2 N gene 515089.2188 2157.2146 B1000-1
A1 3 N gene 514001.7812 -236.8966 B1000-1
네 번째 행을 구문 분석하고 다음과 같이 A.txt
일부 정보를 마지막 열에 붙여넣고 싶습니다 .B.csv
Well Cycle Target Name Rn ΔRn Sample Name Plate Name
A1 1 N gene 512629.375 1004.0445 B1000-1 plate7587
A1 2 N gene 515089.2188 2157.2146 B1000-1 plate7587
A1 3 N gene 514001.7812 -236.8966 B1000-1 plate7587
B.txt
유사한 구문 분석 부분을 시도했지만 작동하지만 마지막 열에 붙여넣고 "보드 이름"을 제목으로 추가하는 방법을 모르겠습니다 .
awk 'BEGIN{OFS=FS=" = "} NR==4{split($2,a,"-")}
어떤 아이디어가 있나요?
감사해요
답변1
A.txt에 실험 이름만 있는 경우 다음을 수행할 수 있습니다.
$ awk -F";" '/Experiment Name/{ split($1,a,"-"); } NR>FNR{ if(FNR==1) print $0" Plate name"; else print $0" "a[3] }' A.txt B.csv > tmp && mv tmp B.csv
Well Cycle Target Name Rn ΔRn Sample Name Plate name
A1 1 N gene 512629.375 1004.0445 B1000-1 plate7587
A1 2 N gene 515089.2188 2157.2146 B1000-1 plate7587
A1 3 N gene 514001.7812 -236.8966 B1000-1 plate7587
답변2
v1=`awk 'NR==4{print $0}' p3| awk -F "-" '{gsub(";","",$3);print $3}'`
awk -v v1="$v1" 'BEGIN{print "Well Cycle Target Name Rn ΔRn Sample Plate Name"}NR>1{$NF=v1;print }' p4
산출
Well Cycle Target Name Rn ΔRn Sample Plate Name
A1 1 N gene 512629.375 1004.0445 plate7587
A1 2 N gene 515089.2188 2157.2146 plate7587
A1 3 N gene 514001.7812 -236.8966 plate7587