다음과 같은 파일이 있습니다.
head cleandata.map
1 1:775852:T:C 0 775852
1 1:1120590:A:C 0 1120590
1 1:1145994:T:C 0 1145994
1 1:1148494:A:G 0 1148494
...
또 다른 파일이 있습니다:
head lifted.map
1 1:775852:T:C 0.0 785989
1 1:1120590:A:C 0.0 1130727
1 1:1145994:T:C 0.0 1156131
1 1:1148494:A:G 0.0 1158631
...
내가 얻고 싶은 것은 cleandata.map을 다음과 같이 변경하는 것입니다.
1 1:785989:T:C 0 785989
1 1:1130727:A:C 0 1130727
1 1:1156131:T:C 0 1156131
1 1:1158631:A:G 0 1158631
...
따라서 리프트.map의 열 2에 있는 행이 cleandata.map의 열 2에 있는 행과 일치하는 경우 cleandata.map의 열 2와 4에 있는 행을 리프트.map의 열 4 값으로 바꿉니다.
답변1
노력하다
$ awk 'FNR==NR {T[$2] = $4; next} $2 in T {gsub ($4, T[$2])} 1' file2 file1
1 1:785989:T:C 0 785989
1 1:1130727:A:C 0 1130727
1 1:1156131:T:C 0 1156131
1 1:1158631:A:G 0 1158631