#chr fivep threep strand sample1 sample2 sample3 sample4 name1 name2
chrI 9442 9492 + 0 0 0 0 na na
chrI 12584 12631 + 0 0 0 0 na na
chrI 12584 12679 + 16 16 15 22 na na
chrI 12584 12727 + 0 0 0 0 na na
chrI 12632 12679 + 13 12 16 9 na na
위 형식의 파일이 있습니다. 기본적으로 샘플1, 샘플2 등의 열인 출력 이름으로 4개의 개별 파일을 얻을 수 있도록 출력을 원합니다.
예를 들어, 제가 하고 싶은 일은 다음과 같습니다.
awk -v OFS="\t" '{print $1,$2,$3,$9":"$10,$5,$4}' > sample1.txt
awk -v OFS="\t" '{print $1,$2,$3,$9":"$10,$6,$4}' > sample2.txt
awk -v OFS="\t" '{print $1,$2,$3,$9":"$10,$7,$4}' > sample3.txt
awk -v OFS="\t" '{print $1,$2,$3,$9":"$10,$8,$4}' > sample4.txt
몇 개의 열에 대해 이 작업을 수행할 수 있지만 많은 열이 포함된 대용량 파일이 있습니다. 각 awk 문을 개별적으로 입력할 필요가 없도록 루프에서 이 작업을 수행하는 방법
답변1
for 루프( ksh93, bash, zsh)를 사용하세요.
for ((i=5;i<=8;i++)); do
awk -v i="$i" -v OFS="\t" 'NR==1{fname=$i".txt"}{print $1,$2,$3,$9":"$10,$i,$4 > fname}' infile
done
시작 및 끝 필드는 루프에 제공됩니다 for. 출력 파일 이름은 접미사가 추가된 헤더 행에서 추출되며 .txt리디렉션은 awk.