mohammad@abbasi ~/NGS/Data/RESULTS/TR
$ java -jar ~/NGS/programs/Trimmomatic-0.39/trimmomatic-0.39.jar PE DRR000001_1.fastq DRR000001_2.fastq -baseout GgG.fastq HEADCROP:15 LEADING:30 TRAILING:30 MINLEN:50; done
-bash: syntax error near unexpected token `done'
(base)
답변1
귀하의 줄은 루프( , , )를 끝내기 위한 쉘 구문 ; done인 으로 끝나지만 루프를 시작하지 않습니다. 쉘은 어떤 루프를 종료해야 할지 모르기 때문에 도착 시 혼란스러워집니다.doneforwhileuntildone