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두 파일 간에 일부 열이 일치하는 경우 파일 2의 열을 파일 1로 복사하는 방법

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두 파일 간에 일부 열이 일치하는 경우 파일 2의 열을 파일 1로 복사하는 방법

파일이 있어요

head top_candidates
    25 elevation_e gene1 20 9 0.0246022994932004 5 8 10.9217937824527
    30 elevation_e gene1 59 18 0.0246022994932004 7 12 15.653559774527
    31 elevation_e gene3 34 10 0.0246022994932004 6 9 9.47018201139585
    108 elevation_e gene3 18 6 0.0246022994932004 4 7 6.86419248099239

그리고 또 다른 파일

head genes.bed
Chr00c0001  52974   70567   gene1
Chr00c0003  32983   33237   gene2
Chr00c0003  36241   36792   gene3
Chr00c0003  100286  101468  gene4
Chr00c0004  80876   93710   gene5

파일 2의 열 4(gene1,2,..)가 파일 1의 열 3과 일치하면 두 번째 파일의 열 1,2, 3을 첫 번째 파일에 붙여넣고 싶습니다.

내가 원하는 출력:

head desired
25 elevation_e gene1 20 9 0.0246022994932004 5 8 10.9217937824527 Chr00c0001    52974   70567 
30 elevation_e gene1 59 18 0.0246022994932004 7 12 15.653559774527 Chr00c0001    52974   70567 
31 elevation_e gene3 34 10 0.0246022994932004 6 9 9.47018201139585 Chr00c0003    36241   36792
108 elevation_e gene3 18 6 0.0246022994932004 4 7 6.86419248099239 Chr00c0003    36241   36792

답변1

어때요?

awk 'NR == FNR {T[$4] = $1 FS $2 FS $3; next} FNR == 1 {print "head desired"; next} {print $0, T[$3]}' file2 file1
head desired
    25 elevation_e gene1 20 9 0.0246022994932004 5 8 10.9217937824527 Chr00c0001 52974 70567
    30 elevation_e gene1 59 18 0.0246022994932004 7 12 15.653559774527 Chr00c0001 52974 70567
    31 elevation_e gene3 34 10 0.0246022994932004 6 9 9.47018201139585 Chr00c0003 36241 36792
    108 elevation_e gene3 18 6 0.0246022994932004 4 7 6.86419248099239 Chr00c0003 36241 36792

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