">"가 포함된 fasta 형식을 일반 텍스트 파일로 변환하는 방법 예: fasta 파일
>1M14
GATCGGACTAGCTAA
출력: 일반 텍스트 파일
GATCGGACGAGCTAA
답변1
fasta 파일 형식이미 일반 텍스트 형식입니다. 당신이 원하는 것은 fasta 파일을 DNA 서열만을 포함하는 파일로 변환하는 것입니다.
fasta 파일에서 모든 헤더 행을 제거하려면 다음으로 시작하는 행을 제거하십시오 >.
grep -v '^>' fastafile >newfile
한 번 살펴보고 싶을 수도 있습니다StackExchange 생물정보학 웹사이트.
이 grep -v명령은 주어진 정규식과 일치하는 행을 삭제합니다. 정규 표현식은 ^>문자로 시작하는 줄과 일치합니다 >.
끝을 보아라이전 질문 중 하나에 대한 내 답변DNA 서열만 포함된 파일을 역보완, 보완 및/또는 역보완하는 방법을 알아보세요.