여러 파일에 대해 여러 입력을 사용하여 명령 실행

일련의 입력 파일( .faa예: 파일)을 반복하여 다른 입력 파일과 출력 파일 이름을 생성할 수 있습니다.

for f in *.faa; do
    ./pal2nal.pl "$f" "${f%.faa}.fna" -codontable 11 -output paml > "${f%.faa}.paml"
done

이 ${f%word}구문은 가장 짧은 후행 구성요소 일치를 제거합니다 word.

주문하다

seq -w 0 6000

0부터 6000까지의 모든 숫자가 생성됩니다. 숫자가 4자리 미만인 경우 왼쪽이 0으로 채워집니다. 명령 대체를 사용하여 명령을 for 루프로 래핑할 수 있습니다.

for n in $(seq -w 0 6000) ;do
  ./pal2nal.pl abc$n.faa abc$n.fna -codontable 11 -output paml > abc$n.paml
done