R 개발 도구를 설치하고 디지털화하는 방법은 무엇입니까?

나는해야한다개발 도구이 기능이 필요하기 때문에install_githubCRAN이 아닌 패키지 설치디지털화 여기. 제가 설치한 R것은

sudo apt-get install r-cran-robustbase

terdon의 답변에서 제안한 대로 R용 패키지를 즉시 설치하지 않았지만 권한을 수정할 수 있었습니다.

sudo chmod 755 /usr/lib/R/site-library/

이게 기본 설정인 것 같아요. 그런 다음 성공적으로 설치된 rcs의 답변 제안을 따라야 했지만 다음을 사용해야만 했습니다 devtools.tpoisot/digitize

sudo apt-get install libssl-dev
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev
R
install.packages('httr')
install.packages('git2r')
install.packages('devtools')
library(devtools)
install.packages('readbitmap')
install_github('tpoisot/digitize')

마지막 명령의 출력은 다음과 같습니다.

Skipping install for github remote, the SHA1 (d16e28b9) has not changed since last install.
  Use `force = TRUE` to force installation

이렇게 하세요 install_github('tpoisot/digitize', force = TRUE). 하지만 아마도 다음과 같은 결과를 얻게 될 것입니다.

...
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet  \
  CMD INSTALL '/tmp/RtmpX8eOLX/devtools57475d25a113/tpoisot-digitize-d16e28b'  \
  --library='/usr/local/lib/R/site-library' --install-tests 

Error: ERROR: no permission to install to directory ‘/usr/local/lib/R/site-library’
Error: Command failed (1)

아무것도 찾을 수 없습니다 sudo. 이렇게 하고 sudo R같은 일을 반복하면 얻을 수 있습니다.

...
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet  \
  CMD INSTALL '/tmp/RtmpAlAT4e/devtools57e864e8c490/tpoisot-digitize-d16e28b'  \
  --library='/usr/local/lib/R/site-library' --install-tests 

* installing *source* package ‘digitize’ ...
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (digitize)

masi에서 없이 작업하려면 기존 그룹에 추가하세요 staff. 새로 설치할 때도 필요합니다.sudoR

sudo usermod -a -G staff masi

설치 테스트

1. 나는 투어 가이드의 지시를 따랐다여기. 나는 테스트 이미지를 시작 하고 사용한 적이 R없습니다 .$HOME/Pictures/sudo여기.

2. 마우스로 축의 네 점을 선택합니다.cal = digitize::ReadAndCal('Rintro-snail1.jpg')

3. 수동으로 수행 data.points = digitize::DigitData(col = 'red')하고 데이터 포인트가 될 포인트를 선택하세요.

4. 두 번째 클릭으로 Plot 창을 닫습니다.

5. 해 df = digitize::Calibrate(data.points, cal, 0.1, 0.4, 0.0, 0.6)보고df

          x  y
   1  71.50 NA
   2  65.65 NA
   ...
   24 26.80 NA
   

   행위head(df)

         x  y
   1 71.50 NA
   2 65.65 NA
   3 64.60 NA
   4 60.85 NA
   5 59.05 NA
   6 58.15 NA
   

설치 세부사항

• 내부 R와 외부sudo

  > .Library
  [1] "/usr/lib/R/library"
  > > .libPaths()
  [1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"      
  [3] "/usr/lib/R/library"  
  

• ls /usr/lib/R/library/목록에 없는 명령은 무엇 입니까 devtools? 왜?

  base       compiler   grid        methods   rpart    survival
  boot       datasets   KernSmooth  mgcv      spatial  tcltk
  class      foreign    lattice     nlme      splines  tools
  cluster    graphics   MASS        nnet      stats    translations
  codetools  grDevices  Matrix      parallel  stats4   utils
  

• 주문하다ls -la /usr/local/lib/R/

  total 12
  drwxrwsr-x 3 root staff 4096 touko 19 22:25 .
  drwxr-xr-x 5 root root  4096 touko 19 22:25 ..
  drwxrwsr-x 2 root staff 4096 touko 19 22:25 site-library
  

• 주문하다ls -la /usr/local/lib/

  total 20
  drwxr-xr-x  5 root root  4096 touko 19 22:25 .
  drwxr-xr-x 14 root root  4096 touko 19 22:13 ..
  drwxrwsr-x  4 root staff 4096 huhti 21 01:13 python2.7
  drwxrwsr-x  3 root staff 4096 huhti 21 01:08 python3.5
  drwxrwsr-x  3 root staff 4096 touko 19 22:25 R
  

• 주문하다R_LIBS_USER="/usr/local/lib/R/site-library/" R

   R version 3.2.3 (2015-12-10) -- "Wooden Christmas-Tree"
   Copyright (C) 2015 The R Foundation for Statistical Computing
   Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
   ...
  

• library(devtools)로드되었습니다

차동 도구

• 이 프로젝트는 더 인기가 있고 효과가 더 좋습니다. https://github.com/markummitchell/engauge-digitizer

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• 클린 시스템 없음: 14.04, 15.10 등에서 업그레이드된 시스템
• 이전 항목으로 인해 권한/소유자가 엉망이 되었습니다.
• 그 과정에서 내가 저지른 실수들.
• 장애 발생시 백업이 되지 않습니다.
• ...
• 누락된 문서

시스템: Ubuntu 16.04 64비트 새로 설치
하드웨어: Dell PC 2013, Macbook Air 2013-mid,...