Unix(OSX)에서 패키지, 디렉터리 및 PATH 관리

저는 주로 독학으로 생물정보학 박사 학위를 취득했습니다. 이제 다양한 디렉터리 구조(예: 내 데이터)를 정리하려고 합니다. 하지만 사용 중인 다양한 생물정보학 패키지를 저장하는 방법도 생각하고 있습니다. . 정식 교육을 받은 적도 없고 Unix 과정을 하나만 수강했기 때문에 "Unix 101"이나 이와 유사한 언어로 가르쳤다고 생각하는 것이 아직도 많습니다. 인터넷 검색을 좀 해보았지만 제 질문에 대한 답을 찾지 못해서 여기에 질문을 드려야겠다고 생각했습니다. 저는 Mac에서 작업하고 있으므로 OSX(Yosemite)도 중요합니다.

내가 사용하고 있는 다양한 패키지를 다운로드하고 설치할 때 현재 해결 방법은 전체 다운로드 디렉터리를 복사하여 /Users/sajber/software모든 파일을 포함하는 것 입니다 make(해당되는 경우, 다운로드 디렉터리에 미리 만들어진 바이너리가 있는 경우도 있음). /Users/sajber/bin그런 다음 어떤 형태의 패키지 관리 소프트웨어 도 사용하지 않으므로 모든 작업을 수동으로 수행했습니다 PATH./Users/sajber/bin

이것이 얼마나 "잘못"되었으며 어떻게 개선할 수 있습니까? 사람들이 평소에 하는 일에 대한 일종의 기준이 있나요?

모든 패키지를 이전과 같이 유지하는 대신에 에서와 같이 /Users/sajber/software개별 패키지를 추가하는 방법을 생각했습니다 . 처음에는 이렇게 했지만 경로가 너무 엉망이 되어 실수 없이 변경하기가 어려워서 현재 솔루션을 사용했습니다. 이제 생각해 보니 이것이 "더 나은" 솔루션이라면 더 쉽게 액세스할 수 있도록 각 패키지에 별도의 줄(위에서 언급한 대로)을 제공하도록 변경할 수도 있습니다.PATHPATH=$PATH:/Users/sajber/software/<package>PATH.bash_profile

또한 /Users/sajber/scripts에 추가한 다양한 Python, R 및 bash 스크립트용 폴더도 있습니다 PATH. Git이 디렉토리에는 버전 제어를 위한 저장소가 있습니다. 이것이 당신이 일을 해야 하는 방식인가요?

이 질문이 매우 기본적이라면 죄송합니다! 나는 Unix 환경에서 일을 하는 표준 방법이 무엇인지 몰랐고 대부분 독학했습니다.