%EC%9D%98%20%EC%B6%9C%EB%A0%A5%EC%9D%84%20%EB%8B%A4%EB%A5%B8%20%ED%94%84%EB%A1%9C%EA%B7%B8%EB%9E%A8(bamToBed)%EC%9C%BC%EB%A1%9C%20%EC%A0%84%EB%8B%AC%ED%95%98%EB%8A%94%20%EB%8D%B0%20%EC%8B%A4%ED%8C%A8%ED%95%A9%EB%8B%88%EB%8B%A4..png)
다음과 같이 한 명령의 출력을 다른 프로그램으로 파이프하려면 어떻게 해야 합니까?
samtools view -bf 0x2 p1163.novo.tier2.bam | bamToBed -i stdin | coverageBed -a stdin -b genes.bed
하지만 내 터미널에서는 표준 입력이 작동하지 않습니다.
답변1
bamToBed -i /dev/stdin
또는
bamToBed -i -
작동해야합니다. 오류가 있습니다.
편집: -b
samtools 옵션이 중요합니다.