다음과 같이 한 명령의 출력을 다른 프로그램으로 파이프하려면 어떻게 해야 합니까?
samtools view -bf 0x2 p1163.novo.tier2.bam | bamToBed -i stdin | coverageBed -a stdin -b genes.bed
하지만 내 터미널에서는 표준 입력이 작동하지 않습니다.
답변1
bamToBed -i /dev/stdin
또는
bamToBed -i -
작동해야합니다. 오류가 있습니다.
편집: -b
samtools 옵션이 중요합니다.