터미널을 사용하여 여러 tiff 이미지를 단일 텍스트 파일의 xyz 좌표로 변환하는 방법은 무엇입니까?

Question 1

ImageMagick에서 더 간단한 스크립트를 사용한 다음 sed출력을 사용합니다. 문제는 Z 이미지를 결정하는 것입니다.

Z=27의 이미지가 DCM0027.tif이고 1부터 420까지의 이미지가 있다고 가정합니다.

그런 다음 숫자를 기반으로 파일 이름을 생성하고 파일 자체를 구문 분석해야 합니다. 사용 편의성을 위해 XYZ.txt 파일이 증분식으로 생성됩니다.

 #!/bin/sh

 rm -f XYZ.txt
 for i in $( seq 1 420 ); do
      FILE=$( printf "DCM%04d.tif" )
      convert -depth 8 -colorspace gray $FILE txt:- \
         | sed -e "s/^\\([0-9]*\\),\\([0-9]*\\):.*gray(\\([0-9]*\\))/\1,\2,$i,\3/g' >> XYZ.txt
 done

위의 내용은 스크립트로 실행되어야 합니다(img.sh 등에 저장됨). 숫자 1과 420을 매개변수화해야 하는 경우 $1과 $2로 바꿀 수 있습니다. 그런 다음 실행됩니다 img.sh 1 420.

또 다른 가능성은 스크립트 자체를 리디렉션하는 것입니다.

 #!/bin/sh
 for i in $( seq $1 $2 ); do
      FILE=$( printf $3 )
      convert -depth 8 -colorspace gray $FILE txt:- \
         | sed -e "s/^\\([0-9]*\\),\\([0-9]*\\):.*gray(\\([0-9]*\\))/\1,\2,$i,\3/g'
 done

두 개의 숫자가 필요합니다그리고파일 이름 구조 및 저장된 데이터 리디렉션:

 img.sh 1 500 "DCM%04d.tif" > XYZ.txt

"%04d"는 "4자리 숫자, 0으로 채워짐"을 의미합니다. 즉, 0001, 0002, 0003입니다. 번호가 DCM1FILE.tif, DCM9FILE.tif, DCM10FILE.tif 등인 경우 "DCM%dFILE.tif"를 파일 모드로 사용할 수 있습니다.

마지막으로 폴더에 .tif 파일 수가 필요한 경우 다음을 사용할 수 있습니다 $( ls *.tif | wc -l )(더 쉬운 방법이 있을 수 있음).

 img.sh 1 $( ls DCM*.tif | wc -l) "DCM%04d.tif" > XYZ.txt

Answer

ImageMagick에서 더 간단한 스크립트를 사용한 다음 sed출력을 사용합니다. 문제는 Z 이미지를 결정하는 것입니다.

Z=27의 이미지가 DCM0027.tif이고 1부터 420까지의 이미지가 있다고 가정합니다.

그런 다음 숫자를 기반으로 파일 이름을 생성하고 파일 자체를 구문 분석해야 합니다. 사용 편의성을 위해 XYZ.txt 파일이 증분식으로 생성됩니다.

 #!/bin/sh

 rm -f XYZ.txt
 for i in $( seq 1 420 ); do
      FILE=$( printf "DCM%04d.tif" )
      convert -depth 8 -colorspace gray $FILE txt:- \
         | sed -e "s/^\\([0-9]*\\),\\([0-9]*\\):.*gray(\\([0-9]*\\))/\1,\2,$i,\3/g' >> XYZ.txt
 done

위의 내용은 스크립트로 실행되어야 합니다(img.sh 등에 저장됨). 숫자 1과 420을 매개변수화해야 하는 경우 $1과 $2로 바꿀 수 있습니다. 그런 다음 실행됩니다 img.sh 1 420.

또 다른 가능성은 스크립트 자체를 리디렉션하는 것입니다.

 #!/bin/sh
 for i in $( seq $1 $2 ); do
      FILE=$( printf $3 )
      convert -depth 8 -colorspace gray $FILE txt:- \
         | sed -e "s/^\\([0-9]*\\),\\([0-9]*\\):.*gray(\\([0-9]*\\))/\1,\2,$i,\3/g'
 done

두 개의 숫자가 필요합니다그리고파일 이름 구조 및 저장된 데이터 리디렉션:

 img.sh 1 500 "DCM%04d.tif" > XYZ.txt

"%04d"는 "4자리 숫자, 0으로 채워짐"을 의미합니다. 즉, 0001, 0002, 0003입니다. 번호가 DCM1FILE.tif, DCM9FILE.tif, DCM10FILE.tif 등인 경우 "DCM%dFILE.tif"를 파일 모드로 사용할 수 있습니다.

마지막으로 폴더에 .tif 파일 수가 필요한 경우 다음을 사용할 수 있습니다 $( ls *.tif | wc -l )(더 쉬운 방법이 있을 수 있음).

 img.sh 1 $( ls DCM*.tif | wc -l) "DCM%04d.tif" > XYZ.txt

Question 2

@Iserni에게 감사드립니다. 귀하의 노력에 감사드립니다. 그러나 귀하의 스크립트를 이해하지 못하는 것 같습니다.

그건 그렇고, 마침내 나는 이 문제를 해결했고 여기에 게시하게 되었습니다. 아마도 누군가에게 유용할 것입니다.

파일의 .tiff 회색조에서 .txt로, z 좌표는 다음과 같습니다.

x y z Gray (always zero)

한 이미지가 언제 끝나고 다른 이미지가 시작되는지 알려면 "z" 값의 변화를 살펴보세요. 컴파일한 chmod +x ./script.sh다음:

./script.sh>xyzfile.txt

폴더에는 이미지와 스크립트만 있다는 것을 잊지 마세요.

#!/bin/bash 
z=0 
for i in pic*; do
 z=$[$z+1] 
convert -depth 8 -colorspace Gray $i txt:- |
 tail -n +2 | tr -cs '0-9.\n' ' ' |
 while read x y Gray junk;
 do if [ "$Gray" -eq 0 ]; then 
echo "$x $y $z $Gray"
 fi
 done
 done

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