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getopts에 전달된 옵션이 충분하지 않은 것을 감지하는 방법

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getopts에 전달된 옵션이 충분하지 않은 것을 감지하는 방법

매개변수가 충분하지 않다는 것을 사용자에게 알려주는 코드 줄을 추가하고 싶습니다. (아마 어딘가에 오류 메시지가 있을 것입니다. 하지만 어디에 있는지 잘 모르겠습니다.)

blastfile=
comparefile=
referencegenome=
referenceCDS=

help='''
  USAGE:   sh lincRNA_pipeline.sh
    -c   </path/to/cuffcompare_output file>
    -g   </path/to/reference genome file>
    -r   </path/to/reference CDS file>
    -b   </path/to/RNA file>
'''

while getopts ":b:c:g:hr:" opt; do
  case $opt in
    b)
      blastfile=$OPTARG
      ;;
    c)
      comparefile=$OPTARG
      ;;
    h)
      printf "$help"
      exit 1
      ;;
    g)
      referencegenome=$OPTARG
      ;;
    r)
     referenceCDS=$OPTARG
      ;;
    \?)
      echo "Invalid option: -$OPTARG" >&2
      exit 1
      ;;
    :)
      echo "Option -$OPTARG requires an argument." >&2
      exit 1
      ;;
  esac
done

답변1

한 가지 방법은 getopts옵션을 구문 분석할 때 옵션 수를 세는 것입니다. 주어진 금액보다 적은 금액이 전달되면 종료할 수 있습니다.

#!/usr/bin/env bash
blastfile=
comparefile=
referencegenome=
referenceCDS=

help='''
  USAGE:   sh lincRNA_pipeline.sh
    -c   </path/to/cuffcompare_output file>
    -g   </path/to/reference genome file>
    -r   </path/to/reference CDS file>
    -b   </path/to/RNA file>
'''

while getopts ":b:c:g:hr:" opt; do
    ## Count the opts
    let optnum++
    case $opt in
        b)
            blastfile=$OPTARG
            echo "$blastfile"
            ;;
        c)
            comparefile=$OPTARG
            ;;
        h)
            printf "$help"
            exit 1
            ;;
        g)
            referencegenome=$OPTARG
            ;;
        r)
            referenceCDS=$OPTARG
            ;;
        \?)
            echo "Invalid option: -$OPTARG" >&2
            exit 1
            ;;
        :)
            echo "Option -$OPTARG requires an argument." >&2
            exit 1
            ;;
    esac
done

[[ $opts -lt 3 ]] && echo "At least 3 parameters must be given"

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