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두 파일의 결합이며 새 파일에서 고유합니다.

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두 파일의 결합이며 새 파일에서 고유합니다.

아래와 같이 변경 사항이 거의 없고 다른 열도 거의 없는 유사한 첫 번째, 두 번째 및 세 번째 열이 있는 두 개의 파일이 있습니다.

파일 1:

AT1  AT22  24  1 ATAGATA ATTATAT
AT2  AT24  22  0 ATAGATA ATTATAT
AT3  AT23  263 3 ATAGATA ATTATAT
AT4  AT28  252 6 ATAGATA ATTATAT

또한 파일 2에서:

AT1  AT22  22  1 ATAGATA ATTATAT
AT3  AT23  265  1 ATAGATA ATTATAT
AT4  AT28  253  1 ATAGATA ATTATAT

출력은 세 번째 열에 + 또는 -2 완화를 적용하여 이러한 파일을 통합하고 고유해야 합니다. 처음 세 열이 이러한 조건과 일치하면 두 파일 모두에서 네 번째 열을 추가해야 하며, 다른 파일은 평소대로 인쇄해야 합니다. 마치

AT1  AT22  24  2 ATAGATA ATTATAT
AT2  AT24  22  0 ATAGATA ATTATAT
AT3  AT23  263 4 ATAGATA ATTATAT
AT4  AT28  252 7 ATAGATA ATTATAT

답변1

awk '
    NR==FNR {
        a[$1,$2] = $3
        val[$1,$2] = $4
        next
    } 
    ($1,$2) in a {
        for (n=$3-2; n<=$3+2; n++)
            if (a[$1,$2] == n) {
                $4+=val[$1,$2]
                break
            }
    } 
    {print}
' file2 file1

AT1 AT22 24 2 ATAGATA ATTATAT
AT2  AT24  22  0 ATAGATA ATTATAT
AT3 AT23 263 4 ATAGATA ATTATAT
AT4 AT28 252 7 ATAGATA ATTATAT

답변2

이는 귀하의 요구 사항을 충족해야 합니다(내 테스트 사례에 관한 한).

#!/bin/bash

# Concatenating the 2 files and sorting entries

SRC=`cat file1 file2 | sort `
FLAG="OFF"
i=1

while read a b c d e

do
 # Need an initial array to start comparing
 if [ "$i" -eq "1"  ];then
  init_vals=( "$a" "$b" "$c" "$d" "$e" )
  FLAG="ON"
 else
  # Start comparing
  vals=( "$a" "$b" "$c" "$d" "$e" )
  if [[ ${vals[0]} ==  "${init_vals[0]}" && ${vals[1]} == "${init_vals[1]}" ]]
   then
    # First and second column are identical, checking in delta on third meet the requirements
    delta=`expr ${vals[2]} - ${init_vals[2]}`
    if [ "$delta" -ge "-2" -a "$delta" -le "2" ]
    then
      # It does, adding values on column 4 and keeping other columns
      sum_col4=`expr ${vals[3]} + ${init_vals[3]}`
      vals=( "${init_vals[0]}" "${init_vals[1]}" "${init_vals[2]}" "$sum_col4" "${init_vals[4]}" )
      #This is a tracker, we don't print result until conditions are not met
      FLAG="ON"
    else
      #Delta on column 3 is not met
      FLAG="OFF"
    fi
  else
    #Column 1 and 2 are different
    FLAG="OFF"
  fi
#    echo "$FLAG"

   if [[ $FLAG != "ON" ]];then
     echo ${init_vals[@]}
     FLAG="ON"
   fi
   init_vals=( "${vals[@]}" )

 fi
 (( i++ ))
done <<< "$SRC"
#Printing last lastline
echo ${init_vals[@]}

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