여러 시퀀스 파일이 있습니다.
>abc|d017961
sequence1......
>cdf|rhtdm9
sequence2......
>ijm|smthr12
sequence3......
>abc|d011wejr
sequence4......
>stg|eethwe77
sequence5......
파일을 편집하고 결과 파일을 다음과 같이 만들고 싶습니다.
>abc_ABC__d017961
sequence1......
>cdf_CDF__rhtdm9
sequence2......
>ijm_IJM__smthr12
sequence3......
>abc_ABC__d011wejr
sequence4......
>stg_STG__eethwe77
sequence5......
답변1
GNU 사용 sed:
sed 's/>\([^|]*\)|/>\1_\U\1__/'
다음과 동일 perl:
perl -pe's/>(.*?)\|/>$1_\U$1__/'