파일 1.txt
id No
gi|371443199|gb|JH556661.1| 7907290
gi|371443198|gb|JH556662.1| 7573913
gi|371443197|gb|JH556663.1| 7384412
gi|371440577|gb|JH559283.1| 6931777
파일 2.txt
id P R S
gi|367088741|gb|AGAJ01056324.1| 5 5 0
gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0
gi|367090281|gb|AGAJ01054784.1| 4 4 0
gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2
출력.txt
id P R S NO
gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0 7573913
gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2 6931777
File1.txt에는 2개의 열이 있고 File2.txt에는 4개의 열이 있습니다. 고유한 ID를 가진 두 파일을 결합하고 싶습니다(배열[1]은 두 파일(file1.txt 및 file2.txt)에서 일치해야 함). 일치하는 ID 출력만 제공하고 싶습니다(output.txt 참조).
나는 열심히 노력했다 join -v <(sort file1.txt) <(sort file2.txt)
. awk 또는 Join 명령에 대한 도움을 요청합니다.
답변1
join
좋은 결과:
$ join <(sort File1.txt) <(sort File2.txt) | column -t | tac
id No P R S
gi|371443198|gb|JH556662.1| 7573913 2 2 0
gi|371440577|gb|JH559283.1| 6931777 21 19 2
추신: 출력 열 순서가 중요합니까?
그렇다면 다음을 사용하십시오.
$ join <(sort 1) <(sort 2) | tac | awk '{print $1,$3,$4,$5,$2}' | column -t
id P R S No
gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0 7573913
gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2 6931777
답변2
그것을 사용하는 한 가지 방법 awk
:
콘텐츠 script.awk
:
## Process first file of arguments. Save 'id' as key and 'No' as value
## of a hash.
FNR == NR {
if ( FNR == 1 ) {
header = $2
next
}
hash[ $1 ] = $2
next
}
## Process second file of arguments. Print header in first line and for
## the rest check if first field is found in the hash.
FNR < NR {
if ( $1 in hash || FNR == 1 ) {
printf "%s %s\n", $0, ( FNR == 1 ? header : hash[ $1 ] )
}
}
다음과 같이 실행하세요:
awk -f script.awk File1.txt File2.txt | column -t
결과는 다음과 같습니다.
id P R S NO
gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0 7573913
gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2 6931777