MPI 프로그램이 즉시 시작되지 않습니다(Fedora)

죄송합니다. 여기에서 물어보는 것이 좋을지 아니면 Stack Overflow에 묻는 것이 더 좋은지 잘 모르겠습니다. 하지만 이것은 새로운 Fedora 39 설치에 관한 것이며 dnf를 통해 설치된 패키지인 mpich-devel, openmpi를 사용했습니다. devel 및 (linux-homebrew에서) openmpi에서도 동일한 문제가 발생합니다. 아무래도 시스템과 관련이 있는 것 같아서 여기에 물어보는 게 좋겠다고 생각했어요.

기본적으로 MPI_Init가 포함된 MPI 프로그램을 실행하려고 하면 실행되지만 실제로 시작하는 데 시간이 오래 걸립니다. 바로 나타나지도 않고 top어떤 이유에서인지 지연되는 것 같습니다. 그렇게 했을 때, 예상했던 것만큼 빠르게 작동했습니다. 이것은 Fortran 언어로 작성된 간단한 Hello World MPI 프로그램입니다.

program hello_world
    use mpi
    implicit none
    integer :: mpi_size, mpi_rank
    integer :: ierr
    double precision :: t1, t2

    call MPI_Init(ierr)
    t1 = MPI_Wtime()

    call MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, mpi_size, ierr)
    call MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, mpi_rank, ierr)

    print*, "Hello from rank ", mpi_rank, " of ", mpi_size, "."

    t2 = MPI_Wtime()
    print*, "time for full program", t2-t1
    call MPI_Finalize(ierr)

end program hello_world

mpif90(오류 없음)으로 컴파일하고 몇 분 정도 지연하여 실행할 수 있습니다. 이 문제의 원인이 무엇인지 찾아봤고 유사한 게시물에서 다른 프로그램을 닫고 Wi-Fi를 비활성화할 것을 제안했지만(이유는 확실하지 않음) 이들 중 어느 것도 도움이 되지 않았습니다.

이것이 출력이다time mpirun -np 2 ./a.out

 Hello from rank            0  of            2 .
 time for full program   1.3940195000000001E-002
 Hello from rank            1  of            2 .
 time for full program   1.4017349000000000E-002

real    2m27.524s
user    0m0.033s
sys 0m0.163s

비교를 위해 여기에 더 간단한 Hello World 프로그램이 있습니다.

program hello
    print *, 'Hello, World!'
end program hello

을 사용하여 컴파일 mpif90하고 시간을 측정하면(여기서는 gfortran과 비교하기 위해 하나의 프로세서를 사용하여 실행) 다음과 같은 결과를 얻습니다.

 Hello, World!

real    1m13.201s
user    0m0.016s
sys 0m0.074s

./a.outgfortran 사용하기(또는 사용하여 실행해도 상관없음 mpirun -np 1 ./a.out)

 Hello, World!

real    0m0.002s
user    0m0.001s
sys 0m0.001s

또한 기다리지 않고 간헐적으로 작동하는 것처럼 보입니다. (업데이트를 통해 문제가 해결되었다고 생각하여 문제를 삭제해도 충분했지만 다시 실행했을 때 문제가 다시 발생했습니다.)

편집: 어떻게든 문제가 있는 것 같습니다 MPI_Init. 다음과 같이 전화를 걸 수 있습니다.

    call date_and_time(values=values)
    print *, values(5),":",values(6),":",values(7),":",values(8)

특정 라인의 시간을 찾으면 병목 현상이 발생합니다 MPI_Init.

예: 프로그램 시작 시간:

17 : 20 : 6 : 221

뒤쪽에 MPI_Init:

17 : 21 : 21 : 128

뒤쪽에 MPI_Finalize:

17 : 21 : 21 : 132