GNU sed여기 초보자...
다음 형식의 헤더가 포함된 FASTA 파일(50K)이 여러 개 있습니다.
CYTC2889-12|Homo sapiens
나는 밑줄을 추가하여
CYTC2889-12|Homo_sapiens
그리고 그 결과를 파일에 씁니다.
저는 macOS에서 실행 중입니다.
나는 노력했다
sed -i.bak 's/\s/_/g' file.fas
하지만 이것은
>CYTC2889-12|Homo _apien_
비슷하지만 정확하지 않습니다.
어떤 아이디어가 있나요?
답변1
다음을 시도해 보세요.
sed -i'.bak' 's/[[:space:]]/_/g' file.fas
Linux를 사용하고 있어서 GNU sed작동 sed -i 's/\s/_/g'하지만 명령을 사용하면 sed --posix -i 's/\s/_/g'작동하지 않습니다.
따라서 Linux에서 posix를 사용하려면 다음을 사용해야 합니다.
sed --posix -i'.bak' 's/[[:space:]]/_/g' file.fas