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Archlinux에 DESeq2 설치

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Archlinux에 DESeq2 설치

추천을 실행해 보았습니다설치 참고 사항:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("DESeq2")

오랫동안 인쇄한 후 이 메시지를 확인했습니다.

Warning messages:
1: In .inet_warning(msg) :
  installation of package ‘genefilter’ had non-zero exit status
2: In .inet_warning(msg) :
  installation of package ‘DESeq2’ had non-zero exit status

우분투에서도 이 문제를 발견했는데 안정적으로 해결되었습니다.이 답변. 그런데 libcurl-opensslArch에 패키지를 설치할 수 없습니다 .

Archlinux에 DESeq2를 설치하는 방법은 무엇입니까?

답변1

이것이 지금 당장 얼마나 도움이 될지는 모르겠지만 R Studio 시스템에 문제가 될 수 있습니다 gcc-fortran. 다음을 실행해 보세요.

sudo pacman -S gcc-fortran

동일한 문제가 발생했을 때 이것은 나에게 효과적이었습니다.

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