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이름 스프레드시트를 사용하여 많은 파일의 부분 이름을 고유한 이름으로 변경

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이름 스프레드시트를 사용하여 많은 파일의 부분 이름을 고유한 이름으로 변경

나는 도움이 필요해. bash를 사용하여 고유한 파일 이름으로 많은 파일의 이름을 바꾸고 싶습니다. 원본 파일 이름의 일부를 유지하고 싶습니다.

예를 들어:

현재 파일 이름 새 파일 이름
F1.R23.fastq.gz 10_1.F1.R23.fastq.gz
F2.R7.fastq.gz 비어 있음_3_1.F2.R7.fastq.gz
F32.R3.fastq.gz 63_3.F32.R3.fastq.gz
F5.R7.fastq.gz Blank_3.F5.R7.fastq.gz
F2.R2.fastq.gz N5_1.F2.R2.fastq.gz

내가 가지고 있는 것은 원래 이름이 있는 열과 이름에 추가하려는 내용이 있는 열이 있는 파일입니다. 이와 같이:

문서 견본
F1.R23.fastq.gz 10_1
F2.R7.fastq.gz 비어있음_3_1
F32.R3.fastq.gz 63_3
F5.R7.fastq.gz 공백_3
F2.R2.fastq.gz N5_1

누구든지 이 작업을 수행할 수 있는 방법이 있다면 매우 감사하겠습니다. 이름을 바꿔야 하는 파일이 수천 개 있을 수 있으며 그 중 일부는 이름이 복잡하고 순서가 무작위이므로 이 작업을 수동으로 수행하는 것은 실제로 불가능합니다.

감사합니다!

답변1

files-to-rename.csv먼저 스프레드시트를 CSV 형식으로 변환하거나 라는 CSV 파일을 만듭니다 . 파일 내용은 다음과 같아야 합니다.

F1.R23.fastq.gz,10_1
F2.R7.fastq.gz,empty_3_1
F32.R3.fastq.gz,63_3
F5.R7.fastq.gz,Blank_3
F2.R2.fastq.gz,N5_1

그런 다음 이 명령을 실행하여 파일과 동일한 디렉터리에 있는지 확인합니다.

while IFS=$',\r' read -r source dest ; do
  mv -v "$source" "${dest}.${source}"
done < files-to-rename.csv

csv 파일에 DOS 줄 끝이 있으면 위 방법이 작동하지 않습니다. 이 dos2unix files-to-rename.csv명령을 사용하여 파일이 UNIX 줄로 끝나는지 확인할 수 있습니다.

그렇지 않은 경우에는 다음과 같은 더 안전한 코드 조각을 사용하세요.

while read line; do
  source=$(echo $line | cut -d, -f1)
  dest=$(echo $line | cut -d, -f2)

  mv -v "$source" "${dest}.${source}"
done < files-to-rename.csv

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