다른 파일을 기반으로 여러 파일의 이름 바꾸기

이름 바꾸기 유틸리티가 설치되지 않은 경우 언제든지 자체적으로 롤아웃할 수 있지만 추가 기능은 없습니다.

perl -le 'local $/;
  my %h = <STDIN> =~ /^(.*) (.*)$/mg;
  rename $_, s/^[^.]+/$h{$&}/r
    for @ARGV;
' *cram* < names.homologs.txt

Pearl의 표준 입력에 있는 원본 파일을 사용하여 이름 맵 해시를 초기화하고 이를 후속 이름 바꾸기 명령에 적용할 수 있습니다.

파일 이름에 개행 문자가 없으므로 sed를 사용하여 이를 수행할 수 있습니다.

sed -Ee '
  1i\
h
  s|\S+|s/^[.][/]&[.]/|
  s||.\\/&./;ta|2
$a\
:a\
G\
s/(.*)\\n(.*)/\\2 \\1/
' names.homologs.txt > genMvPairs

  find . -maxdepth 1 -type f -name '*.cram*' |
  sed -Ef genMvPairs - | xargs -n2 -t mv -f

Linux 시스템을 사용 중이거나 perl rename 명령( 운영 체제에 따라 또는 이라고 부를 수 있음)에 액세스할 수 있고 ID에 공백이나 기타 공백이 있을 수 없다고 가정하면 다음을 수행할 수 rename있습니다 prename. perl-rename수행원:

while read id hom; do
    rename -n "s/^$id/$hom/" "$id".*
done < names.homologs.txt

이는 수행할 작업을 인쇄할 뿐 실제로 이름을 바꾸지는 않습니다. 요구 사항을 충족하는지 확인한 후에는 -n실제로 변경하도록 선택하지 않고 다시 실행하세요.

또는 셸에서 다음을 수행할 수 있습니다.

while read id hom; do
    for file in "$id".*; do
        newFile=$(printf '%s\n' "$file" | sed "s/$id/$hom/")
        mv -- "$file" "$newFile"
    done
done < names.homologs.txt

그러나 이는 이름 충돌이 없고(파일의 새 이름이 기존 파일 이름과 일치하는 경우 기존 파일을 덮어쓰게 됨) 파일 이름에 개행 문자가 없다고 가정합니다(파일의 새 이름이 기존 파일 이름과 일치함). 임시 파일을 사용하면 실제로 안전해야 합니다. 가정).

이는 하반기와 비슷한 것으로 나타났다.테든의 답변하지만 저는 파일의 새 이름을 계산하는 데 더 안전하고 빠른 방법을 사용하고 있습니다.

사용 /bin/sh:

#!/bin/sh

while read -r id homolog; do
        for oldname in "$id".*; do
                [ -e "$oldname" ] || continue
                newname=$homolog.${oldname#$id.}
                mv -- "$oldname" "$newname"
        done
done <names.homologs.txt

이는 이름을 바꾸려는 파일이 현재 디렉터리에 있다고 가정합니다. 스크립트는 파일의 각 줄에서 두 문자열을 읽어 names.homologs.txt두 개의 변수 idsum 으로 읽습니다 homolog.

각각에 대해 일치하는 이름을 가진 현재 디렉터리의 파일을 id통해 루프를 시도합니다 . "$id".*이러한 각 파일에 대해 존재하는 경우 유틸리티를 사용하여 $id.문자열의 시작 부분에 있는 부분을 .$homolog.mv

이름 충돌은 확인되지 않습니다.

bash@terdon이 말했듯이 파일 이름에 이상한 문자가 없고 수많은 동족체가 없는 순수한 솔루션은 다음과 같습니다.

#!/usr/bin/env bash

declare -a homologs

while read key val
do {
  homologs["$key"]="$val"
} done < names.homologs.txt


while read file
do
# key is the part before the dot
  key="${file%%.*}"
# end is part after the first dot to the end
  end="${file#*.}"
  printf 'mv -- "%s" "%s.%s"\n' "${file}" "${homologs["$key"]}" "$end"
done