awk는 필드를 숫자로 인식하지 않습니다

awk는 필드를 숫자로 인식하지 않습니다

나는 이것이 간단한 문제라고 생각하지만 무슨 일이 일어나고 있는지 이해하지 못합니다. 다음과 같은 파일이 있습니다.

Scaffold_19:10402053-10402986   Scaffold_33:25064012-25064819   92.806  278 5   5   8   279 269 1   2.84e-107   388
Scaffold_6:54625155-54625833    Scaffold_33:6634011-6634353 96.774  248 6   2   1   248 97  342 1.21e-114   412
Scaffold_9:94800251-94801152    Scaffold_26:56326990-56327448   100.000 297 0   0   1   297 162 458 1.19e-155   549
Scaffold_20:79074547-79075122   Scaffold_20:79075175-79076351   93.269  208 11  3   1   208 972 1176    6.43e-82    303
Scaffold_18:6685836-6686898 Scaffold_19:81178714-81179662   99.789  949 1   1   114 1062    1   948 0.0 1740
Scaffold_18:46725018-46726185   Scaffold_18:46723864-46724938   84.309  752 73  29  1   710 323 1071    0.0 693
Scaffold_9:97974338-97975523    Scaffold_9:97976642-97978267    90.239  1045    81  18  155 1185    1   1038    0.0 1345
Scaffold_16:35667544-35671350   Scaffold_34:16160847-16161438   99.459  185 0   1   1   184 185 1   1.56e-90    335
Scaffold_33:47202231-47202984   Scaffold_33:47205382-47206652   94.763  611 31  1   3   613 642 1251    0.0 950
Scaffold_8:18583199-18586799    Scaffold_25:14231844-14235013   98.460  3116    43  3   1   3112    55  3169    0.0 5483

이제 내가 하고 싶은 것은 세 번째 열에 <=가 있는 행을 숫자로 인쇄하는 것입니다. 그건 쉬울 거에요, 그렇죠? 예를 들어 $3 <= 100 인 줄을 인쇄합니다.

head q.filtered.noself.blastn|awk '$3 <= 100'

하지만 아무것도 반환하지 않습니다! 도와주세요? 이는 awk가 세 번째 필드가 숫자임을 인식하지 못하는 것과 같습니다.

Ubuntu 20.04.2에서 mawk 1.3.4 20200120을 사용하고 있습니다.

다음은 파일의 예입니다. 견본

편집: 이것은 로케일의 출력입니다.

locale
LANG=en_GB.UTF-8
LANGUAGE=en_GB:en
LC_CTYPE="en_GB.UTF-8"
LC_NUMERIC=fr_BE.UTF-8
LC_TIME=fr_BE.UTF-8
LC_COLLATE="en_GB.UTF-8"
LC_MONETARY=fr_BE.UTF-8
LC_MESSAGES="en_GB.UTF-8"
LC_PAPER=fr_BE.UTF-8
LC_NAME=fr_BE.UTF-8
LC_ADDRESS=fr_BE.UTF-8
LC_TELEPHONE=fr_BE.UTF-8
LC_MEASUREMENT=fr_BE.UTF-8
LC_IDENTIFICATION=fr_BE.UTF-8
LC_ALL=

답변1

문제는 LC_NUMERIC=fr_BE.UTF-8이 로케일에서는 소수 구분 기호가 있고 숫자 ,가 아니기 .때문에 98.9숫자로 간주되지 않는다는 것입니다. 표시하려면:

$ echo "98.5" | LC_NUMERIC=C mawk '$1<100' 
98.5
$ echo "98.5" | LC_NUMERIC=fr_BE.UTF-8 mawk '$1<100' 
$ 

따라서 로케일을 .소수 구분 기호가 있는 로케일로 변경하거나 이 명령에 대해 명시적으로 로케일을 설정하십시오.

head q.filtered.noself.blastn | LC_NUMERIC=C awk '$3 <= 100'

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