다음과 같이 통합 분석 형식으로 변경하려는 탭으로 구분된 모델 입력 파일이 있습니다.
cat input.txt
#############################################
### Parameter file for the program ###
#############################################
### GENERAL PARAMETERS
4 /* nbout # Number of outputs */
46 /* numesp # Number of species */
0.05 /* p # light incidence param (diff through turbid medium) */
0.1357158 0.2446549 0.3535940 0.4992873 0.6449806 0.6957850 0.7465893 0.8130218 0.8794543 0.9397271 1.0000000 0.9397271 0.8794543 0.8078294 0.7362045 0.6899817 0.6437589 0.5989616 0.5541642 0.4617186 0.3692730 0.3633708 0.3574686 0.2426215 /* normalized daily light course (from 7am to 7pm, with a half-hour time-step */
1 /* vox_la_max. The max voxel leaf area. */
0 /* l_growth_scheme. 0 = top down; 1 = random; 2 = homogeneous; 3 = bottom up */
0.1 /* knockout_max. Parameter controlling the extent to which lianas can knock out trees */
0.05 /* shed_prob. With this probability, the liana is completely shed from the voxel. */
### Species description
**** Nmass LMA wsg dmax hmax ah tmax seedmass Fregdistgr Pmass g1 s_liana
Alvaradoa_amorphoides 0.0214 74.775 0.584 0.5 24.44 0.892 1 0.0078 40 0.00145 3.77 0
Annona_reticulata 0.0350 74.529 0.503 0.5 24.44 0.892 1 0.2392 40 0.00142 3.77 0
Brosimum_alicastrum 0.0201 104.281 0.760 0.5 17.31 0.117 1 1.2486 40 0.00097 3.77 0
### Climate (input environment)
25.47447 26.02723 26.87827 27.58436 26.95839 25.63987 25.61669 25.26543 24.99990 24.10808 24.71997 24.67287 /*Temperature in degree C*/
다음 형식의 배포판에서 탭으로 구분된 다른 승수 파일을 선택했습니다.
cat multipliers.txt
2 3 4
3 2 2
4 3 3
3개의 특정 입력 필드에 승수를 곱하여 나머지 입력 파일은 변경하지 않고 승수 수(이 경우 3)와 동일한 일련의 새 입력 파일을 생성하려고 합니다. 이 경우 첫 번째 파일에는 vox_la_max
, knockout_max
, shed_prob
2, 3, 4, 두 번째 파일에는 3, 2, 2, 세 번째 파일에는 4, 3, 3을 곱하고 싶습니다 . 아래와 같이 3개의 새 파일을 생성하겠습니다.
cat input1.txt
#############################################
### Parameter file for the program ###
#############################################
### GENERAL PARAMETERS
4 /* nbout # Number of outputs */
46 /* numesp # Number of species */
0.05 /* p # light incidence param (diff through turbid medium) */
0.1357158 0.2446549 0.3535940 0.4992873 0.6449806 0.6957850 0.7465893 0.8130218 0.8794543 0.9397271 1.0000000 0.9397271 0.8794543 0.8078294 0.7362045 0.6899817 0.6437589 0.5989616 0.5541642 0.4617186 0.3692730 0.3633708 0.3574686 0.2426215 /* normalized daily light course (from 7am to 7pm, with a half-hour time-step */
2 /* vox_la_max. The max voxel leaf area. */
0 /* l_growth_scheme. 0 = top down; 1 = random; 2 = homogeneous; 3 = bottom up */
0.3 /* knockout_max. Parameter controlling the extent to which lianas can knock out trees */
0.2 /* shed_prob. With this probability, the liana is completely shed from the voxel. */
### Species description
**** Nmass LMA wsg dmax hmax ah tmax seedmass Fregdistgr Pmass g1 s_liana
Alvaradoa_amorphoides 0.0214 74.775 0.584 0.5 24.44 0.892 1 0.0078 40 0.00145 3.77 0
Annona_reticulata 0.0350 74.529 0.503 0.5 24.44 0.892 1 0.2392 40 0.00142 3.77 0
Brosimum_alicastrum 0.0201 104.281 0.760 0.5 17.31 0.117 1 1.2486 40 0.00097 3.77 0
### Climate (input environment)
25.47447 26.02723 26.87827 27.58436 26.95839 25.63987 25.61669 25.26543 24.99990 24.10808 24.71997 24.67287 /*Temperature in degree C*/
cat input2.txt
#############################################
### Parameter file for the program ###
#############################################
### GENERAL PARAMETERS
4 /* nbout # Number of outputs */
46 /* numesp # Number of species */
0.05 /* p # light incidence param (diff through turbid medium) */
0.1357158 0.2446549 0.3535940 0.4992873 0.6449806 0.6957850 0.7465893 0.8130218 0.8794543 0.9397271 1.0000000 0.9397271 0.8794543 0.8078294 0.7362045 0.6899817 0.6437589 0.5989616 0.5541642 0.4617186 0.3692730 0.3633708 0.3574686 0.2426215 /* normalized daily light course (from 7am to 7pm, with a half-hour time-step */
3 /* vox_la_max. The max voxel leaf area. */
0 /* l_growth_scheme. 0 = top down; 1 = random; 2 = homogeneous; 3 = bottom up */
0.2 /* knockout_max. Parameter controlling the extent to which lianas can knock out trees */
0.1 /* shed_prob. With this probability, the liana is completely shed from the voxel. */
### Species description
**** Nmass LMA wsg dmax hmax ah tmax seedmass Fregdistgr Pmass g1 s_liana
Alvaradoa_amorphoides 0.0214 74.775 0.584 0.5 24.44 0.892 1 0.0078 40 0.00145 3.77 0
Annona_reticulata 0.0350 74.529 0.503 0.5 24.44 0.892 1 0.2392 40 0.00142 3.77 0
Brosimum_alicastrum 0.0201 104.281 0.760 0.5 17.31 0.117 1 1.2486 40 0.00097 3.77 0
### Climate (input environment)
25.47447 26.02723 26.87827 27.58436 26.95839 25.63987 25.61669 25.26543 24.99990 24.10808 24.71997 24.67287 /*Temperature in degree C*/
cat input3.txt
#############################################
### Parameter file for the program ###
#############################################
### GENERAL PARAMETERS
4 /* nbout # Number of outputs */
46 /* numesp # Number of species */
0.05 /* p # light incidence param (diff through turbid medium) */
0.1357158 0.2446549 0.3535940 0.4992873 0.6449806 0.6957850 0.7465893 0.8130218 0.8794543 0.9397271 1.0000000 0.9397271 0.8794543 0.8078294 0.7362045 0.6899817 0.6437589 0.5989616 0.5541642 0.4617186 0.3692730 0.3633708 0.3574686 0.2426215 /* normalized daily light course (from 7am to 7pm, with a half-hour time-step */
4 /* vox_la_max. The max voxel leaf area. */
0 /* l_growth_scheme. 0 = top down; 1 = random; 2 = homogeneous; 3 = bottom up */
0.3 /* knockout_max. Parameter controlling the extent to which lianas can knock out trees */
0.15 /* shed_prob. With this probability, the liana is completely shed from the voxel. */
### Species description
**** Nmass LMA wsg dmax hmax ah tmax seedmass Fregdistgr Pmass g1 s_liana
Alvaradoa_amorphoides 0.0214 74.775 0.584 0.5 24.44 0.892 1 0.0078 40 0.00145 3.77 0
Annona_reticulata 0.0350 74.529 0.503 0.5 24.44 0.892 1 0.2392 40 0.00142 3.77 0
Brosimum_alicastrum 0.0201 104.281 0.760 0.5 17.31 0.117 1 1.2486 40 0.00097 3.77 0
### Climate (input environment)
25.47447 26.02723 26.87827 27.58436 26.95839 25.63987 25.61669 25.26543 24.99990 24.10808 24.71997 24.67287 /*Temperature in degree C*/
awk를 사용해야 할 것 같은데 지금까지는 열 승수 파일을 사용하여 한 번에 하나의 매개변수만 성공적으로 변경할 수 있었고 동시에 3개의 매개변수를 모두 변경할 수 있어야 합니다. 이러한 출력을 생성하려면 어떤 종류의 스크립트를 설정할 수 있습니까?
답변1
TL;박사:awk
귀하의 예를 위해 하드코딩된 압축 스크립트
NR != FNR {
out = "out" FNR ".txt"
printf "" > out
for (l=m=1; l <= nl; l++)
printf tmpl[l] ORS, l in vals ? $(m++)*vals[l] : 0 >> out
close(out)
next
}
{
gsub(/%/, "%%")
# here is the regex that selects the fields by their name
if ($3 ~ /^(vox_la_max|knockout_max|shed_prob)[^[:alnum:]_]*$/) {
vals[NR] = $1
sub(/^[0-9]+(\.[0-9]+)?/, OFMT)
}
tmpl[NR] = $0; nl++
}
다음과 같이 사용하세요:
LC_NUMERIC=C awk -f script input.txt multipliers.txt
라는 출력 파일이 생성됩니다 outX.txt
.
LC_NUMERIC=C
이 비트는 로케일에서 부동 소수점 값의 소수 구분 기호로 점 대신 쉼표를 사용하는 경우 필요합니다.
단순화를 위해 합리적으로 보이는 몇 가지 가정을 세웠습니다.
- 필수 입력 필드는 항상 필드 이름이 한 단어이고 공백(최소 하나의 공백)으로 구분되어야 함을 나타내는 주석이 인접한 별도의 값입니다.
/*
- 같은 이름의 필드가 없습니다.
- 부동 소수점 값은 숫자와 (아마도) 점으로만 표현됩니다. 즉, 지수나 기타 과학적 표현은 사용하지 않습니다.
위와 동일하지만 다음을 허용하도록 상세하고 설명되고 확장되었습니다.
- 행 번호별로 필수 항목을 임의로 지정
- 각 필드에 속하는 입력 라인의 주석으로 참조되는 이름으로 필수 필드를 임의로 지정합니다.
- 출력 파일은 확장자(예: .txt)를 가질 수 있는 입력 파일 이름을 따라 자동으로 이름이 지정되며 표시된 경로(있는 경우)는 다음과 같아야 합니다.아니요즉, 입력 파일이 포함된 디렉터리에서 스크립트를 실행하는 것이 더 좋습니다.
# some preparations
BEGIN {
# output files named as the input file name
split(ARGV[1], f, ".")
outpfx = f[1]
# remember wanted fields specified on command line as comma-separated line numbers
if (nums) {
# split variable "nums" on comma into helper array "r"
n = split(nums, r, ",")
# loop over helper array to build final array, thus indexed by wanted line numbers
while (n) rows[r[n--]]
}
}
# here we operate on multipliers file
NR != FNR {
# output file name for this set of multipliers
out = outpfx FNR ".txt"
# create/overwrite this output file
printf "" > out
# loop over template lines scanned from input file
for (linenum = multnum = 1; linenum <= numlines; linenum++)
# use the template line as printf format string to consume values to be multiplied (if any)
printf tmpl[linenum] ORS, linenum in wanted_values ? $(multnum++)*wanted_values[linenum] : 0 >> out
close(out)
next
}
# here we scan the input file to build a template for printf
{
# escape existing % chars as we are going to leverage printfs own format string which is %-based
gsub(/%/, "%%")
# on specified line numbers or named fields:
if (NR in rows || names && match($3, "^("names")[^[:alnum:]_]*$")) {
# remember this value
wanted_values[NR] = $1
# replace the original value with the printfs conversion specification for floating-point values
# it will be used by printf later on while processing the multipliers file
sub(/^[0-9]+(\.[0-9]+)?/, OFMT)
}
# remember this whole line as a template
tmpl[NR] = $0; numlines++
}
다음과 같이 사용하세요:
# specify fields by their line numbers, each separated by a comma
LC_NUMERIC=C awk -f script -v nums=36,38,39 input.txt multipliers.txt
# or specify fields by their names, each separated by the | character (NOTE it's a regexp)
LC_NUMERIC=C awk -f script -v names='vox_la_max|knockout_max|shed_prob' input.txt multipliers.txt
# or also use both ways of specifying fields
LC_NUMERIC=C awk -f script -v nums=15,112,234,71,5 -v names='vox_la_max|numesp' input.txt multipliers.txt
승수보다 더 많은 필드가 지정되면 초과 필드는 0
(0을 곱함)이 됩니다.
승수보다 적은 수의 필드를 지정하면 초과 승수는 무시됩니다.
어떤 경우든 필드는 항상 표시된 줄 번호 순서대로 승수를 사용합니다. 즉, 입력 파일에서 발견된 첫 번째 필드는 해당 필드를 지정하는 방법에 관계없이 첫 번째 승수를 사용합니다.
답변2
사용진주출력 파일을 생성합니다.
perl -wMstrict -pale '
BEGIN {
## variables declaration
use vars qw($name $extn);
use vars qw($header $template $footer);
use vars qw(@glob_params $num_re);
## pick apart include.txt filename into its components
($name, $extn) =
pop =~ m{(.*?)(\.[^.]*|)$}x;
## split and stuff into variables the include.txt file
($header, $template, $footer) =
do{local $/;<STDIN>;} =~
m{\A
(.*?\n)
(\#+\h*GENERAL\h+PARAMETERS\h*\n.*?\n\n)
(.*)
}xms;
## names of global parameters to vary
@glob_params =
qw( vox_la_max knockout_max shed_prob);
# cinstruct the regex to search for numbers
my $sign = qr{ [-+] }x;
my $float = qr{ \d+(?:\.\d*)?|\.\d+ }x;
my $exponent = qr{ [eE][-+]?\d+ }x;
$num_re =
qr{ $sign? $float $exponent? }x;
}
##### multiplier.txt processed from here onwards
my %mult;
@mult{ @glob_params } = @F;
my $template_copy = $template;
for (@glob_params) {
$template_copy =~
s{^($num_re)(?=\h+/\*\h*\Q$_\E\b)}{$1 * $mult{$_}}xme;
}
my $out = sprintf "%s%d%s",
$name, $., $extn;
open my $fh, ">", $out
or die "Opening $out for writing:$!";
select $fh;
s/.*/$header$template_copy$footer/;
' multipliers.txt < include.txt include.txt