faLinux 터미널에서 사용하기 위해 파일 형식을 변환하려고 합니다 fq. seqkit명령은 간단하며 아래와 같습니다.
seqkit fq2fa Std_metabat2_bin.9_sub.fa -o Std_metabat2_bin.9_sub.fq -j 20
그러나 200개 이상의 파일(메타게놈 파일 저장소)이 있는데 fa한 번에 하나의 파일을 변환하는 것보다 더 좋은 방법이 있는지 궁금합니다.
답변1
for한 가지 해결책은 루프를 사용하여 .fa디렉터리의 모든 파일을 변환하는 것입니다.
for file in *.fa; do seqkit fq2fa "$file" -o $(basename "$file" .fa).fq -j 20; done