Bash의 MATLAB 함수에 배열 변수 전달

목적

변수와 배열 변수를 설정하기 위해 여러 텍스트 파일을 사용하고 있습니다. 이는 이러한 변수를 기반으로 URL 다운로드 문자열을 반복적으로 생성한 다음 MATLAB websave함수를 사용하여 온도 데이터를 다운로드하는 MATLAB 함수에 대한 입력 매개 변수입니다 . 특히 MATLAB 스크립트는 parforfor 루프를 병렬화하고 이를 컴퓨팅 클러스터의 44개 코어에 분산시키는 데 사용되었습니다. MATLAB은 내 노트북에서 실행되지만 매우 느리기 때문에 고성능 클러스터에서 실행해야 합니다.

질문

bash 스크립트에 설정된 변수를 matlab 함수에 전달하는 데 문제가 있습니다. 결국 나는 MATLAB 명령줄에 머물렀습니다. matlab 함수 호출에서 변수 주위의 작은따옴표를 제거하려고 시도했지만 동일한 오류가 발생합니다.

스크립트

cd CRW_Temp_Profiles

# Set Variables
IFS=$'\r\n' GLOBIGNORE='*' command eval  'LatArray=($(cat Lat.txt))'
IFS=$'\r\n' GLOBIGNORE='*' command eval  'LongArray=($(cat Long.txt))'
IFS=$'\r\n' GLOBIGNORE='*' command eval  'SitesArray=($(cat Sites.txt))'
Site=$(echo ${SitesArray[${SLURM_ARRAY_TASK_ID}-1]})
FileType=".csv"

# Check Variables were read properly
echo 'Site is Number '${Site}
echo 'Row-specific LatLons are:'
echo '    deg N = '${LatArray[${SLURM_ARRAY_TASK_ID}-1]}
echo '    deg S = '${LongArray[${SLURM_ARRAY_TASK_ID}-1]}
echo ' All Lats are'
echo ${LatArray[*]}

# run MATLAB function
module load MATLAB
matlab -nodisplay -nojvm -nodesktop -nosplash -r "try; f_Download_CRW_Temp('$LatArray', '$LongArray', "1985", "2019", '$Site', "44", ".csv"); end; quit;"
module purge

출력 및 오류 메시지

Site is Number 1
Row-specific LatLons are:
    deg N = -16.5
    deg S = 149.8
 All Lats are
-16.5 -20 -19.5 -11.5 -23.5 -21.5 -31.5 ..... <100 entries of site latitudes> .... 11.2 11.2

                                                                                          < M A T L A B (R) >
                                                                                Copyright 1984-2018 The MathWorks, Inc.
                                                                                R2018b (9.5.0.944444) 64-bit (glnxa64)
                                                                                            August 28, 2018


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 try; f_Download_CRW_Temp('-16.5', '149.8', 1985, 2019, '1', 44, .csv); end; quit;
                                                                                   |
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