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여러 txt 파일에 문자열을 전달하는 방법

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여러 txt 파일에 문자열을 전달하는 방법

비슷한 데이터가 있지만 훨씬 더 큽니다. 그래서 나는 다음과 같이 df1.txt를 가지고 있습니다

sp|O15304|SIVA_HUMAN    MPKRSCPFADVAPLQLKVRVSQRELSRGVCAERYSQEVFEKTKRLLFLGAQAYLDHVWDEGCAVVHLPESPKPGPTGAPRAARGQMLIGPDGRLIRSLGQASEADPSGVASIACSSCVRAVDGKAVCGQCERALCGQCVRTCWGCGSVACTLCGLVDCSDMYEKVLCTSCAMFET 
tr|A0A1B1L9R9|A0A1B1L9R9_BACTU  MNKQLFLASLKETQKSILSYACGAALYLWLLIWIFPSMVSAKGLNELIAAMPDSVKKIVGMESPIQNVMDFLAGEYYSLLFIIILTIFCVTVATHLIARHVDKGAMAYLLATPVSRVQIAITQATVLILGLLIIVSVTYVAGLVGAEWFLQDNNLNKELFLKINIVGGLIFLVVSAYSFFFSCICNDERKALSYSASLTILFFVLDMVGKLSDKLEWMKNLSLFTLFRPKEIAEGAYNIWPVSIGLIAGALCIFIVAIVVFKKRDLPL

다음과 같이 df2.txt가 있습니다

sp|O15304|SIVA_HUMAN    IGPDGR

나는 그것들을 결합하려고 노력하고 있으므로 다음을 수행합니다.

join df1.txt df2.txt | awk '{gsub($3, tolower($3), $2) ; print $1 "\t" $2}' > out.txt

나는 이것을 갖고 싶어

sp|O15304|SIVA_HUMAN    MPKRSCPFADVAPLQLKVRVSQRELSRGVCAERYSQEVFEKTKRLLFLGAQAYLDHVWDEGCAVVHLPESPKPGPTGAPRAARGQMLigpdgrLIRSLGQASEADPSGVASIACSSCVRAVDGKAVCGQCERALCGQCVRTCWGCGSVACTLCGLVDCSDMYEKVLCTSCAMFET
tr|A0A1B1L9R9|A0A1B1L9R9_BACTU  MNKQLFLASLKETQKSILSYACGAALYLWLLIWIFPSMVSAKGLNELIAAMPDSVKKIVGMESPIQNVMDFLAGEYYSLLFIIILTIFCVTVATHLIARHVDKGAMAYLLATPVSRVQIAITQATVLILGLLIIVSVTYVAGLVGAEWFLQDNNLNKELFLKINIVGGLIFLVVSAYSFFFSCICNDERKALSYSASLTILFFVLDMVGKLSDKLEWMKNLSLFTLFRPKEIAEGAYNIWPVSIGLIAGALCIFIVAIVVFKKRDLPL

하지만 나에겐 이것이 있다

sp|O15304|SIVA_HUMAN    MPKRSCPFADVAPLQLKVRVSQRELSRGVCAERYSQEVFEKTKRLLFLGAQAYLDHVWDEGCAVVHLPESPKPGPTGAPRAARGQMLigpdgrLIRSLGQASEADPSGVASIACSSCVRAVDGKAVCGQCERALCGQCVRTCWGCGSVACTLCGLVDCSDMYEKVLCTSCAMFET

, 어떻게 해결할 수 있나요?

답변1

문제는 Join 명령에 있습니다. 을 사용해야 합니다 -a 1.

~에서man join

-a FILENUM
       also print unpairable lines from file FILENUM, where
       FILENUM is 1 or  2,  corresponding to FILE1 or FILE2

즉, 최종 주문은

join -a 1 df1.txt df2.txt | awk '{gsub($3, tolower($3), $2) ; print $1 "\t" $2}' > out.txt

배경

문제를 해결할 때 파이프라인의 각 섹션을 순서대로 테스트해야 합니다. join df1.txt df2.txt두 파일의 행만 출력합니다. 에 일치하는 항목 이 df1.txt없는 행을 포함하려면 위와 같이 사용하세요.df2.txt-a 1

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