Bash 파일에서 for 루프 병렬화

제 생각에는병렬화아래 bash 스크립트의 for 루프입니다.

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두 개의 Matlab 스크립트가 있습니다

1) 메인.엠

clear
rng default
P=2;
grid=randn(2,3);
jobs=1;

2) FM

sgetasknum_grid=grid(jobs*(str2double(getenv('SGE_TASK_ID'))-1)+1: str2double(getenv('SGE_TASK_ID'))*jobs,:); %jobsx3

result=sgetasknum_grid+1; 

filename = sprintf('result.%d.mat', ID);
save(filename, 'result')

exit

내가 하고 싶은 것:

• main.m을 실행하고 싶습니다.

• 그럼 FM을 두 번 하고 싶어요평행하게

• 모든 것이 노드에서 실행되어야 합니다.ㅏ

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이건 내 버전이야병렬화 없음

1)Main.m과 fm을 My_folder라는 폴더에 저장했습니다.

2)다음과 같이 bash 파일 td.sh를 생성하여 My_folder 폴더에 저장했습니다.

    #$ -S /bin/bash
    #$ -l h_vmem=5G
    #$ -l tmem=5G
    #$ -l h_rt=480:0:0
    #$ -cwd
    #$ -j y


    #$ -N try

    date
    hostname

    export SGE_TASK_ID

    for SGE_TASK_ID in {1..2}
do
    #Output the Task ID
    echo "Task ID is $SGE_TASK_ID"

  /share/.../matlab -nodisplay -nodesktop -nojvm -nosplash -r "main; ID=$SGE_TASK_ID; f; exit"
done

삼)터미널에 가서 ssh username@A, cd /.../My_folder, 다음을 입력합니다.bash td.sh

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병렬화를 위해, 이 포럼의 많은 답변에서는 사용을 권장합니다 parallel. 나는 bash 파일이 아래와 같다고 생각한다.

#$ -S /bin/bash
#$ -l h_vmem=5G
#$ -l tmem=5G
#$ -l h_rt=480:0:0
#$ -cwd
#$ -j y


#$ -N try

date
hostname

export SGE_TASK_ID

SGE_TASK_ID={1..2}

echo "$SGE_TASK_ID" | parallel -P 2 /share/.../matlab -nodisplay -nodesktop -nojvm -nosplash -r "main; ID=$SGE_TASK_ID; f; exit"

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그러나 이것은 터미널에서 수신되는 오류입니다.

A.local
td.sh: line 16: parallel: command not found

parallel내가 이해한 바로는 기계에 "소프트웨어"가 부족할 수 있습니다 . 설치할 수 있나요? 그렇다면 어떻게 설치하나요? 아니면 시스템 관리자가 설치해야 합니까? 아니면 다른 제안사항이 있으신가요 parallel?

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업데이트: 아래 두 번째 답변의 스크립트를 구현하려고 합니다.

#!/bin/bash -l
#$ -S /bin/bash
#$ -l h_vmem=5G
#$ -l tmem=5G
#$ -l h_rt=480:0:0
#$ -cwd
#$ -j y


#$ -N try

date
hostname

export SGE_TASK_ID

SGE_TASK_ID={1..2}

echo -e SGE_TASK_ID | xargs -I {} -P 4 /share/.../matlab -nodisplay -nodesktop -nojvm -nosplash  -r "main; ID={}; f; exit"

이것은 내가 받은 오류 메시지입니다.

Undefined function or variable 'SGE_TASK_ID'.